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中國科學院大學藥學院

中國科學院大學藥學院（以下簡稱「國科大藥學院」 ）是經2013年3月28日中國科學院大學（以下簡稱「國科大」 ）第六次校長辦公會審議通過並發文批覆 ，於2014年1月16日正式揭牌成立的首批國科大專業學院（校發字〔 2013 〕 55號）  。2019年8月 ，在國科大的專項資助下 ，國科大藥學院領銜國內100餘家高校專家編纂出版第二版《高等藥理學》研究生教材 ，教材一經問世即受到了國內80餘家藥學高校藥學院的青睞 ，必將為我國新藥研發 、藥學學科建設和人才培養做出應有的貢獻 。

中科中山藥物創新研究院

中科中山藥物創新研究院（以下簡稱「中山藥創院」） ，是上海藥物研究所與中山市人民政府共建的新型研發機構 ，中山藥學院是中山藥創院下設的教學機構 。中山藥創院是以中山為總部 ，輻射粵港澳大灣區乃至華南地區的集生物醫藥科研 ，高層次人才培養和科研成果產業化為一體的佔據行業制高點的創新平台 。

藥物科學與技術學院

國科大杭州高等研究院（以下簡稱「杭高院」）是由中國科學院大學和杭州市人民政府共同舉辦的高起點 、小而精的教學科研機構 。

長三角藥學高等工程學院

長三角藥學高等工程學院（以下簡稱工程學院）是長三角藥物高等研究院下設的研究生培養管理機構 ，也是中國科學院大學藥學院辦學體系的延伸 。工程學院秉承「科教融合 、協同育人 、創新實踐 、服務社會」的理念 ，探索多元協同的創新人才培養的新模式 ，建成藥學領域具有國際影響力的高端技術人才培養基地 ，為區域經濟和社會發展服務 。